湖州高新园区创建于1999年5月。次年12月，经浙江省科技厅批准同意，建立省级湖州高新园区，规划面积12.25km。2002年11月，通过由省科技厅组织的专家验收。 目前，湖州高新园区已完成近4km的道路、供电、供热、供气、通讯、给水、排水、排污、绿化等基础设施及市政配套工程，完成投资5.35亿元。
为推动高新技术产业快速发展，为全面实施科教兴市战略，根据省政府关于创建省级高新技术园区精神，湖州市委、市政府决定在湖州开发区内规划面积12。25平方公里面积，创建湖州高新技术产业园区。省级湖州高新技术产业园区创建可行性报告于1999年5月通过省专家组的论证，2000年12月，省科技厅发文同意创建省级湖州高新技术产业园区。湖州高新园区依托湖州经济开发区的组织结构、基础设施、政策条件和现有产业优势，努力发展机电一体化、新材料、生物工程和新医药等高新技术产业，力争把湖州高新园区建设成为环太湖地区高新技术产业密集的重要区域。